ISO28000认证是国际标准化组织针对供应链安全制定的标准，AEO认证则是WCO和各国海关组织制定和推行的认证经营者的标准。

AEO认证的申请者是所有参与国际供应链各环节且有独立法人资格的实体。从这一点来说，AEO认证是有一定申请门槛的，认证时间相对会比较长。目前我国的AEO认证比较适合有一定的进出口量且进出口作业比较复杂，有明确的海关利害需求，需要规范关务有关的作业，存在一定的海关管控风险并有可能加剧，以及国外客户有指定需求的企业。

而ISO 28000可以作为企业结合政府及海关安全要求提供认证的平台， 建制系统完成后，不论各国海关或各国客户采用怎样的安全要求及规范，都可整合纳入系统中运作，节省因满足不同安全要求而花费的成本。因此，相对来说，ISO28000认证现阶段适合的企业范围更大，不论大小企业、是否法人单位，都适用。

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